在土地使用权的相关事务中，国有土地使用证是用地单位合法使用土地的重要凭证。然而，如果发现国有土地使用证存在问题，这可能会引发一系列法律和实际操作上的疑问。那么，当国有土地使用证出现问题时，用地单位的土地使用权是否仍然合法呢？这个问题需要从多个角度进行分析。

首先，我们需要明确什么是国有土地使用证。国有土地使用证是由国土资源管理部门颁发给用地单位的法律文件，证明其对特定地块拥有合法的土地使用权。这份证件通常包含土地的位置、面积、用途等关键信息。如果这些信息存在错误或不完整的情况，就可能影响到证件的有效性。

其次，国有土地使用证的问题可能来源于多种原因。例如，在办理过程中可能存在信息录入错误，或者由于政策调整导致原有信息不再适用。此外，也有可能是因为用地单位自身的原因，如未能及时更新相关信息或隐瞒了部分事实。

针对这些问题，首先应该由用地单位主动向相关部门报告情况，并申请更正或补办手续。如果问题较为严重，甚至可能导致土地使用权的丧失，则需要进一步咨询专业律师，以确定具体的法律责任及应对措施。

同时，值得注意的是，即使国有土地使用证存在问题，也不一定意味着用地单位的土地使用权完全无效。根据我国现行法律法规，在某些情况下，即使证件存在瑕疵，只要用地单位能够提供其他证据证明其对土地享有合法权益，仍可继续行使相关权利。

总之，对于用地单位而言，一旦发现国有土地使用证存在问题，应及时采取行动解决问题，确保自身的合法权益不受损害。同时也要注意遵守法律法规，在日常管理中加强对土地使用的监督与维护，避免类似问题再次发生。